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提速近10倍！基于深度学习的全基因组选择新方法来了******
近日，中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用，将助力深度学习在全基因组选择中的应用，为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物（Molecular Plant）》上。
全基因组选择作为新一代育种技术，通过构建预测模型，根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择，从而缩短育种世代间隔，加快育种进程，节约成本，推动现代育种向精准化和高效化方向发展。
统计模型作为全基因组选择的核心，极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型，难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。
相较于传统模型，非线性模型（如深度网络神经）具备分析复杂非加性效应的能力，人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机，深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。
该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料，通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。
与其他五种主流预测方法相比，该方法有以下优点： 可以利用多组学数据开展全基因组预测；算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构，可以有效降低模型错误率，提高运行速度；预测精度稳健，在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当，在大规模数据集上预测优势更加明显；计算时间与传统方法相近，比已有深度学习方法提速近10倍；超参数调整对用户更加友好。
该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。
学术支持
中国农业科学院作物科学研究所
记者
宋雅娟
宁夏西吉农产品出村进城 首批“西吉好东西”门店集中揭牌******
中新网银川1月17日电 (记者 李佩珊)1月17日，“西吉好东西”推介暨首批门店授牌仪式在宁夏银川市举行。当天，宁夏固原市西吉县农产品“出村进城”，集中亮相首批“西吉好东西”特色产品销售门店，为民众带来丰富购物体验。
现场授牌。 李佩珊 摄西吉县是中国首个“文学之乡”“中国马铃薯之乡”“中国西芹之乡”。因海拔高、光照充足、土壤疏松肥沃、昼夜温差大、气候冷凉，西吉县孕育出牛肉、马铃薯、芹菜、胡麻油等优质农特产品，“西吉好东西”的知名度和市场竞争力不断提高。
琳琅满目的“西吉好东西”。 李佩珊 摄据固原市委副书记、西吉县委书记白学贵介绍，2022年以来，西吉县开展实施农产品出村进城工程，在银川、固原打造“西吉好东西”特色产品销售门店。目前，共有位于银川市、固原市的5家“西吉好东西”特色产品销售门店授牌开业。今年，“西吉好东西”特色产品销售门店还将亮相北京等多地，力争将当地农特产品由“原字号”向“精字号”转变，由“种得好”向“卖得好”转变，由“名气高”向“收益高”转变。
消费者进店选购西吉特产。 李佩珊 摄“西吉好东西”特色产品销售门店001号店长姚春表示，门店将主营西吉牛羊肉、“红军粉”、胡麻油、亚麻籽油、小杂粮、冷凉蔬菜、蜂蜜等30余种“西吉好东西”，为消费者带来生态、绿色、无污染的农特产品。同时，门店还将展示西吉刺绣等非遗产品，让更多民众了解西吉故事。
当天，宁夏农垦农庄有限公司与“西吉好东西”001号店铺签订了供销协议。(完)
（文图：赵筱尘 巫邓炎） [责编：天天中] 阅读剩余全文（）  视觉焦点
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